آنهاحواشى بر كتب حكميه ملاصدرا و ميرداماد است، آثار مستقل وى عبارتند از:
1 . حجة الاسلام ملقب به برهان الملّة در ردّ بخش سوم كتاب «ميزان الحق»
2 . تفسير سوره توحيد به نام السراج المنير
3 . الرقيمة النورية في قاعدة بسيط الحقيقة
4 . شرح حديث زينب عطاره
5 . شرح حديث نورانيت
6 . شرح حديث «هل رأيت رجلاً...»
7 . رساله امامت
8 . رساله در حقيقت قرآن
9 . اجوبه مسايل گوناگون حكمى
پاره اى از حواشى كتب حكمى وى عبارتند از:
1 . حواشى «نبراس الضياء» ميرداماد
2 . حواشى «تقويم الايمان» ميرداماد
3 . حواشى «جذوات» ميرداماد
4 . حواشى «اسفار» ملاصدرا
5 . حواشى «اسرار الايات» ملاصدرا
6 . حواشى «تفسير قرآن» ملاصدرا
7 . حواشى رساله «قضاء و قدر» ملاصدرا؛ و...
پاره اى از حواشى وى بر كتب علوم نقلى عبارتند از:
1 . حاشيه «تفسير صافى» فيض كاشانى
2 . حاشيه «لهوف» سيد بن طاووس و...