احتمالاً تحت تأثیر گفتار شیخ صدوق در باره محمد بن عیسی که «ما تفرد محمد بن عیسی من کتب یونس و حدیثه لا یعتمد علیه»۱ و تضعیف ابن ولید نسبت به روایات اوست که برخی از رجالیان بر وی خرده گرفته‌اند. و حتی شیخ طوسی ضمن تضعیف محمد بن عیسی، وی را در شمار «فیمن لم یرو عن الائمة علیهم السلام » آورده است۲ که این نشان از طعن در روایات وی است.۳ اما برخی همچون ابوالعباس بن نوح در این تضعیف تأمل نموده و از دلیل ابن ولید در این باره ابراز بی اطلاعی کرده‌اند.۴ به هر حال، آنچه در باره محمد بن عیسی در منابع کهن شیعی آمده، مختلف است و سخن در باره وی در جای خود نیاز به تحقیقات وسیع‌تری دارد.
تعداد روایات در الکافی: 756 روایت (سه روایت از طریق الحسن بن علی الهاشمی الدینوری،۵ یک روایت از طریق الحسین بن سعید الأهوازی،۶ یک روایت از طریق الحسین بن عبیدالله بن سهل القمی،۷ 41 روایت از طریق أحمد بن محمد بن خالد البرقی،۸ 32 روایت از طریق أحمد بن محمد بن عیسی الأشعری،۹ چهار روایت از طریق إبراهیم بن هاشم القمی،۱۰ یک روایت از طریق سعد بن عبدالله القمی،۱۱ 69 روایت از طریق سهل بن زیاد الآدمی،۱۲ شش روایت از طریق عبدالله بن جعفر الحمیری،۱۳ سه روایت از طریق علی بن الحسن بن علی بن فضال،۱۴ 503 روایت از طریق علی بن ابراهیم
1.. همان، ص۳۳۳.
2.. رجال النجاشی، ص۳۴۸.
3.. رجال الطوسی، ص۴۴۸.
4.. معرفة الحدیث، ص۲۲۱.
5.. الکافی، ج۴، ۱۴۶، ۱۴۷، ۱۵۰.
6.. همان، ج۶، ص۱۱۶.
7.. همان، ج۱، ص۴۴۰.
8.. همان، ج۱، ص۸۵، ۱۱۰، ۱۲۳؛ ج۲، ص۹۲، ۱۲۵، ۳۳۴، ۳۶۸، ۶۵۰؛ ج۴، ص۱۲؛ ج۵، ص۵۶، ۵۹، ۸۹، ۹۴، ۱۶۲، ۲۹۸، ۳۱۱، ۳۸۲، ۵۱۱،۵۳۰؛ ج۶، ص۲۰، ۲۶۹، ۳۰۶، ۳۱۶، ۳۱۹، ۳۲۴، ۳۲۵، ۳۴۹، ۳۶۱، ۳۶۵، ۳۶۶، ۳۶۸، ۳۷۷، ۴۰۳، ۵۲۹، ۶۳۹.
9.. همان، ج۱، ۱۷۹؛ ج۲، ص۲۰۶، ۲۲۱، ۳۳۲، ۵۲۰، ۶۰۵؛ ج۳، ص۲۳۶؛ ج۵، ص۴۵، ۱۴۴، ۱۹۸، ۲۰۰، ۲۳۷، ۲۴۳، ۲۴۴، ۲۵۹؛ ج۶، ص۳۶، ۳۷، ۱۸۱، ۲۵۵؛ ج۷، ص۴۶، ۵۶، ۶۸، ۴۲۸، ۳۶۹، ۲۳۶.
10.. همان، ج۱، ص۴۶۷؛ ج۳، ص۱۳۵، ۱۳۶؛ ج۶، ص۵۳۶.
11.. همان، ج۱، ص۱۰۷.
12.. همان، ج۱، ص۳۱، ۳۲، ۱۰۲، ۱۲۶، ۱۸۰، ۱۸۸، ۲۸۶، ۲۹۱، ۲۹۳، ۳۰۵، ۴۰۹، ۵۴۷؛ ج۲، ص۱۰۶؛ ج۶، ص۵۳۷؛ ج۷، ص۲۰۴، ۳۱۱، ۴۰۶، ۴۰۸؛ ج۸، ص۱۵۷.
13.. همان، ج۶، ص۳۳۲، ۳۵۸، ۳۶۹، ۳۷۲، ۳۷۳.
14.. همان، ج۴، ص۱۶۰، ۱۶۲.
