اين كتاب را از دو طريق روايت كرده است. طريق اول به نقل از عبداللّه بن احمد بن عامر است و طريق دوم به روايت از داود بن سليمان غازى است. از مواردى كه به طريق اول مطلبى از صحيفة الرضا آمده مى توان به : الخصال ، ج 1 ، ص 208 ، 221 ، 262 ، 322 ، 324 و ج 2 ، ص 344 ، 384 ، 388 ؛ علل الشرايع ، ج 2 ص 493 ، 494 ، 520 ، 554 ، 571 ، 593 ؛ عيون اخبار الرضا عليه السلام ، ج 1 ص 240 و ج 2 ص 24. درباره موارد طريق دوم بنگريد به: الامالى، ص268 ؛ التوحيد ، ص 68 ، 182 ، 369 ، 377 (سند افتادگى دارد)؛ الخصال ، ج1، ص 168 ، 179 ، 196؛ عيون اخبار الرضا عليه السلام ، ج 1 ، ص 127 ، 141 ، 142 ، 227 ، 259 ، 281 ، 313 و ج 2 ، ص 24 ، 57 ، 78؛ معانى الاخبار ، ص 374 ؛ علل الشرايع ، ج 1 ص 272.
يكى از شيوخ روايت كتاب صحيفة الرضا ، عالمى به نام محمد بن على بن الشاه المروزى است. براى شرح حال وى بنگريد به: تاريخ مدينة دمشق ، ج 54 ص 318 ؛ الانساب ، ج 5 ص 262.
پيگيرى اين سلسله سند در آثار مختلف شيخ صدوق نشانگر اين مطلب است كه وى تنها در كتاب من لا يحضره الفقيه از اين كتاب نقل نكرده ، بلكه در باقى آثار خود نيز از اين كتاب نقل روايت كرده است از جمله : ثواب الأعمال ، ص 26 (با تصحيف العمركى بن البوفكى به العمركى عن البوفكى) ، 45 ، 223 ؛ الخصال ، ج 2 ، ص 385 ؛ علل الشرايع ، ج 1 ، ص 81 (با تصحيف نام العمركى البوفكى به المقرى الخراسانى) ، ج 2 ، ص437، 445، 519 ، 521. درباره العمركى بنگريد به : الرجال ، نجاشى، ص 303 ـ 304.
اتان كلبرگ در اشاره به اين كتاب در كتاب خانه ابن طاووس (ص 409) علاوه بر اين كه از نسخه هاى كهن اين كتاب اطلاعى ندارد ، حتى متوجه استفاده كتاب مسائل به عنوان يكى از مصادر كتب اربعه نيز نشده است ، در حالى كه شيخ صدوق و شيخ طوسى در بخش مشيخه كتاب هاى خود ، به استفاده از اين كتاب اشاره كرده اند. كلينى نيز در الكافى از كتاب مسائل على بن جعفر بهره برده است. طريق كلينى در نقل از اين كتاب چنين است :
1 . على بن محمد [و محمد بن الحسن ] عن سهل بن زياد عن موسى بن القاسم بن معاوية البجلى .