هنگام ورود طغرل بيگ -اولين پادشاه سلجوقى- به بغداد ، اين كتاب خانه را سوزاندند .
از جمله كتبى كه در كتاب خانه شاپور طعمه حريق شد ، اصول دعائيه اصحاب ائمه عليهم السلام بود . گر چه اين كتب از بين رفت و به دست ما نرسيد ، لكن محتويات اين كتب ـ يعنى دعاها و اذكار و زيارات ـ به دست ما رسيده است ؛ اين بدان جهت است كه ساليانى پيش از آن آتشسوزى ، تعدادى از بزرگان ، كتاب هايى در باب ادعيه و اعمال و زيارات تأليف كردند و همه روايات اصول دعائيه را استخراج نمودند و در كتب خود نقل كردند . اين كتاب ها اكنون در دست ماست ، مانند :
كتاب دعاى كلينى (م 329 ق)
كتاب كامل الزياره ابن قولويه (م 360 ق)
كتاب دعا و مزار شيخ صدوق (م 381 ق)
كتاب المزار شيخ مفيد (م 413 ق)
كتاب روضة الواعظين كراجكى (م 499 ق) كه تا قرن دهم هجرى در دسترس بوده و از مآخذ كفعمى در بلد الامين است . ^۱

مصباح المتهجد

از جمله كتاب هاى دعايى كه پيش از سوختن اصول قديمى كتاب خانه شاپور به نگارش در آمد ، كتاب گران سنگ مصباح المتهجد تأليف شيخ طوسى (م 460 ق) است .
شيخ طوسى پس از ورود به عراق در سال 408 ق ، احاديث اصول قديمه كتاب خانه شاپور و كتاب خانه استادش سيد مرتضى را استخراج كرد و در باب احكام كتاب تهذيب الأحكام و الاستبصار في ما اختلف من الأخبار را نگاشت و در باب دعا و اعمال ، كتاب مصباح المتهجد را