بخش دوم: فروع (فروعُ الكافى) ، شامل اين كتاب ها:
1 . كتاب الطهارة ؛ 2 . كتاب الحيض ؛ 3 . كتاب الجنائز ؛ 4 . كتاب الصلاة ؛ 5 . كتاب الزكاة؛ 6 . كتاب الصيام ؛ 7 . كتاب الحجّ ؛ 8 . كتاب الجهاد ؛ 9 . كتاب المعيشة ؛ 10 . كتاب النكاح ؛ 11 . كتاب العقيقة ؛ 12 . كتاب الطلاق ؛ 13 . كتاب العتق و التدبير و الكتابة ؛ 14 . كتاب الصيد ؛ 15 . كتاب الذبايح ؛ 16 . كتاب الأطعمة؛ 17 . كتاب الأشربة؛ 18 . كتاب الزىّ و التجمّل و المُروئة؛ 19 . كتاب الدواجن ؛ 20 . كتاب الوصايا ؛ 21 . كتاب المواريث ؛ 22 . كتاب الحدود ؛ 23 . كتاب الديات ؛ 24 . كتاب الشهادات ؛ 25 . كتاب القضاء و الأحكام ؛ 26 . كتاب الأيمان و النذور و الكفّارات .
بخش سوم: كتاب الروضة (روضةُ الكافى) در پند و اندرز و موضوعات پراكنده .
سر آغاز هر كدام از بخش ها چنين است:
آغاز بخش اصول: «الحمد للّه المحمود لنعمته ، المعبود لقدرته ، المطاع فى سلطانه . . . ؛ أمّا بعد ، فقد فهمتُ ـ يا أخى ـ ما شكوتَ من اصطلاح أهل دهرنا على الجهالة» .
آغاز بخش فروع: «الحمد للّه ربّ العالمين . كتاب الطهارة ، باب طهور الماء ، قال أبو جعفر محمد بن يعقوب الكلينى رحمه الله حدّثنى على بن إبراهيم بن هاشم ، عن أبيه ، عن النوفلى ، عن السكونى ، عن أبى عبد اللّه عليه السلام » .
آغاز بخش روضه: «كتاب الروضة ، محمد بن يعقوب الكلينى ، قال حدّثنى على بن إبراهيم ، عن أبيه ، عن ابن فضّال ، عن حفص المؤذّن . . . خرجت هذه الرسالة من أبى عبد اللّه إلى أصحابه: بسم اللّه الرحمن الرحيم ، أمّا بعد ، فاسألوا ربّكم العافية و عليكم بالدَّعة و الوقار» .
كتاب الكافى ، به خاطر ويژگى هايى كه داشته ، در طول بيش از هزار سال ، مورد استقبال و استفاده و مراجعه فراوان دانشمندان شيعى قرار گرفته و از اين ره گذر ، نام عالمان زيادى به عنوان مدرّس يا كاتب يا مقابله كننده يا اجازه دهنده يا اجازه گيرنده

آن ، از امتيازات و افتخارات علمى دانشمندان به شمار آيد ، تا جايى كه عالم جليل القدر ، ابو غالب احمد بن محمد بن سليمان زُرارى ـ مؤلف رسالة فى حال آل أعيَن ـ ، در هنگام بر شمردن كتاب هايى كه در نزدش بوده ،از كتاب الكافى چنين ياد نموده است:
و جميع كتاب تصنيف أبى جعفر محمد بن يعقوب الكلينى ، روايتى عنه بعضه قرائة و بعضه إجازة ، و قد نسختُ منه كتاب الصلاة و الصوم فى نسخة و كتاب الحجّ فى نسخة و كتاب الطهارة و الحيض فى جزء و الجميع مجلّد ، و عزمى أن أنسخ بقيّة الكتاب فى جزء واحد وورق طلحى . ^۱
روشن است كه وى ، اتمام استنساخ الكافى را در شمار كارهاى ضرورى خود ، ياد مى كند ، با اين كه عصر وى به عصر كلينى بسيار نزديك بوده است .
همچنين دانشمند سرشناسى مانند شيخ مفيد ، در باره الكافى چنين مى گويد:
إنَّه أجلّ كتب الشيعة و أكثرها فائدة . ^۲
علّامه مجلسى هم در مقدمه شرحى كه بر احاديث الكافى نوشته و به مرآة العقول موسوم است ، مى گويد:
إنَّه كان أضبط الاُصول و أجمعها و أحسن مؤلّفات الفرقة الناجية و أعظمها . ^۳
كلينى كتابش را در سه بخش و هر بخش را در چند كتاب (به معناى «فصل») و هر كتاب را در چند باب ، سامان داده كه مجموعا 34 كتاب و 326 باب و حدود شانزده هزار حديث را در بر دارد .
فهرست اجمالى بخش ها و موضوعات الكافى ، چنين است:
بخش اول: اصول (اُصولُ الكافى) ، شامل چند كتاب ، بدين ترتيب :
1 . كتاب العقل و الجهل ؛ 2 . كتاب فضل العلم ؛ 3 . كتاب التوحيد ؛ 4 . كتاب الحُجّة ؛ 5 . كتاب الإيمان و الكفر ؛ 6 . كتاب الدعاء ؛ 7 . كتاب فضل القرآن ؛ 8 . كتاب العِشرة .