وفاته:

مات ـ كما يقول النجاشى ـ ببغداد سنة 329ق سنة تناثر النجوم، و تاريخ وفاته عند الشيخ الطوسى سنة 328ق و قال السّيد رضى الدين بن طاووس: «و هذا الشيخ محمد بن يعقوب كانت حياته فى زمن وكلاء الامام المهدى عليه السلام ـ عثمان بن سعيد العمرى، و ولده أبى جعفر محمد، و أبى القاسم الحُسين بن روح، و علىّ بن محمد السمرى ـ و توفى محمد بن يعقوب قبل وفاة علىّ بن محمد السمرىّ، و لأن علىّ بن محمد السمرىّ توفى فى شعبان سنة 329ق، و هذا محمد بن يعقوب الكلينى توفى ببغداد سنة 328ق.

قبره الشريف:

دفن ثقة الاسلام الكلينى بباب الكوفة بمقبرتها فى الجانب الغربى، تزوره الخاصّة و العامة، و صلّى عليه السيد محمد بن جعفر الحسنى معروف بأبى قيراط.

مصادر ترجمته كثيرة منها:

1. رجال السّيد بحرالعلوم.
2. مقابس الأنوار: 6.
3. لؤلؤة البحرين: 386.
4. رياض العلماء: 5: 199.
5. الكنى و الألقاب: 3:120.
6. أعيان الشيعة: 10:99.
7. روضات الجنات: 6:108.
8. رجال الطوسى: 495.
9. رجال النجاشى: 377.
10. رجال العلامة الحلى: 145.
11. جامع الرواة: 2:218.
12. تنقيح المقال: 2:56 باب الميم.